Bovbjerg Fyr blev tegnet af fyringeniør C.F. Grove som et 26 m højt anduvningsfyr med en flammehøjde på 62 m. Fyret blev tændt d. 30. december 1877. Det blev malet rødt for at undgå forveksling med Ferring og Trans Kirker.
Fyrmesteren og to fyrassistenter med familier boede ved fyret. Den sidste fyrmester flyttede i 2003. Bovbjerg Fyr blev automatiseret i 1965, og fyrfunktionen styres fra Fornæs Fyr ved Grenaa.
I 2007 blev fyret indviet som kulturhus drevet af Støtteforeningen for Bovbjerg Fyr. Foran fyret står Erik Heides skulpturgruppe Hyrden fra 2006, opsat i 2008. Fyrmesterboligen blev renoveret 2013‑14.
Fyret er anlagt på Bovbjergs højeste punkt i 42 m’s højde.