Over hver fjerde af arbejdspladserne i Nordfyns Kommune findes inden for landbrug og industri. Virksomhederne ligger spredt over hele kommunen med de største virksomheder i byerne Otterup, Bogense, Søndersø og Hårslev. Dansk Industris barometer for det lokale erhvervsklima placerede i 2020 Nordfyns højest blandt de fynske kommuner.
Kommunen er på en række områder præget af naboskabet til Odense Kommune. Omkring halvdelen af de beskæftigede med bopæl i Nordfyns Kommune pendler til arbejdspladser i andre kommuner, her især Odense. Den sydligste del af Nordfyns Kommune rækker ind i postnummeret Odense N og omfatter bl.a. Hans Christian Andersen Airport ved Beldringe. Trods en afstand på kun 12 km fra Odense Rådhus er lufthavnen hjemmehørende i Nordfyns Kommune, der ligeledes er medejer.
I lighed med de fleste andre kommuner blev også Nordfyns ramt af finanskrisen fra 2008. I kølvandet på krisen mistede kommunen over 1.000 arbejdspladser, især inden for industri, bygge og anlæg samt transport. Endnu i november 2019 havde kommunen færre arbejdspladser end før finanskrisen. Indkomstniveauet var i 2018 ca. 9 % lavere end på landsplan.