Med støtte fra fonde, staten og Kerteminde Kommune kunne Fjord- og Bæltcentret slå dørene op for de første besøgende i marts 1997. Forsknings- og formidlingscenterets bygning er tegnet af Stærmose & Isager, Odense, og ligger ved indsejlingen til Kerteminde Fjord, hvor det ferske fjordvand møder det salte vand fra Storebælt. Centeret, som efterfølgende skiftede navn til Fjord&Bælt, drives i dag med kommunal støtte af en fond; siden 2013 i samdrift med Naturama i Svendborg.
Fjord&Bælt er det eneste sted i Danmark, hvor marsvin kan studeres og opleves i fangenskab. I dag er der tre marsvin, Freja, Saga og Eskild, på centeret. Det 25 år gamle marsvin Freja ankom i april 1997 efter at være gået i et bundgarn. Også Saga og Eskild blev reddet fra bundgarn og kom til Fjord&Bælt i hhv. september og november 2020. Marsvinene studeres af marinbiologer fra Syddansk Universitet, som bl.a. undersøger, hvordan havpattedyr reagerer på forstyrrelse fra menneskelige aktiviteter til havs.
