Helsingør Bymuseum er et bymuseum i Helsingør oprettet i 1911.
Det var Helsingørhistorikeren, overlærer Laurits Pedersen, der tog initiativ til etablering af Helsingør Bymuseum (oprindelig Helsingør Historiske Museum), og han lagde stor vægt på museets forankring i lokalsamfundet. Siden 1973 har museet haft adresse i Karmeliterhuset fra 1516.
Helsingør Bymuseum er en del af Museerne Helsingør.