Københavns Museum er et af de væsentligste kulturhistoriske museer i København. Museet har ansvar for både de arkæologiske udgravninger og registreringer såvel som de kulturhistoriske områder vedrørende nyere tid i Københavns.
Københavns Museum blev oprettet i 1901 som Københavns Rådhusmuseum med permanent udstilling på rådhusets loftsetage i 1925. I perioden 1956-2015 lå museet i Det Kongelige Kjøbenhavnske Skydeselskabs Palæ fra 1787 på Vesterbrogade.
I 2015 blev museet en del af den nyoprettede enhed Historie & Kunst, som hører under Københavns Kommunes Kultur- og Fritidsforvaltning. I 2020, efter fem års nedlukning, kunne museet slå dørene op til helt nye udstillinger i den store bygning i Stormgade fra 1893, som bl.a. har huset Københavns Overformynderi. Museets nye udstillinger formidler Københavns historie fra 15.000 år f.Kr. og frem til den nyeste tid. Metrobyggeriet i København har skabt en stor interesse for arkæologi, og museet åbnede derfor i 2017 et Arkæologisk Værksted i Stormgade 20 for både børn og voksne.
Københavns Museum og virksomheden MAN B&W etablerede i 2006 udstillingsstedet DieselHouse i H.C. Ørsted Værkets dieselbygning.
I 2016 lancerede Københavns Stadsarkiv sitet kbhbilleder.dk, der indeholder over 100.000 fotografier (2019) overvejende fra Københavns Museum og Stadsarkivet.
