Landskabet i Kerteminde Kommune blev dannet i slutningen af sidste istid, Weichsel. Blandt de mange markante landskabsdannelser er buen af bakker, der kiler sig ind mellem Odense Fjord og Kertinge Nor, og som på Låddenhøj i Munkebo Bakke kulminerer i kommunens højeste punkt 58 m.o.h. Omkring Ladby, Revninge og Rynkeby i området syd for Kertinge Nor domineres landskabet af den frugtbare moræneflade, som kendetegner store dele af Nordøstfyn.
Ved Langeskov i syd består landskabet af såkaldte drumlins, som er langstrakte bakker, der er trukket ud i isens bevægelsesretning fra sydøst mod nordvest. Noget atypisk ligger de enkelte bakker som langstrakte øer på Langeskov-Seden Hedeslette. Halvøen Hindsholm er en lavtliggende moræneflade med et stort antal enkeltbakker. De fleste af bakkerne er aflange med en sydøstlignordvestlig orientering, og nogle har plan top.