Moesgaard Museum, MOMU, er en selvejende institution og statsanerkendt som kulturhistorisk specialmuseum for arkæologi og etnografi. Det har arkæologisk ansvar i Aarhus, Favrskov, Odder og Samsø Kommuner og driver også Vikingemuseet. Moesgaards rødder går tilbage til Den Historisk Antikvariske Samling fra 1861. Den holdt til på Aarhus Rådhus, men blev i 1891 overflyttet til Aarhus Museum på Vester Allé under navnet Aarhus Museums Historiske Afdeling.
Efter 2. Verdenskrig kom mange opsigtsvækkende arkæologiske fund til. De første fund fra romersk jernalder i Illerup Å ved Skanderborg blev gjort i 1950. Grauballemanden (ca. 290 f. Kr.) blev fundet i 1952, og den efterfølgende udstilling og konservering vakte enorm opmærksomhed. Museets nyansatte konservator Gunnar Lange-Kornbak valgte at fortsætte den konserveringsproces, som mosen havde indledt, og lægge liget i udtræk af egebark i 18 måneder. Fremstillingen af en montre til liget blev sat på folkeaktier, og museumsfolk kom fra nær og fjern for at se fundet. I 1953 foretog museets leder, P.V. Glob, sammen med Geoffrey Bibby udgravninger i Bahrain og bidrog med afgørende viden om Golfstatens historie.
Et interessentskab af Århus Amt og fem forstadskommuner havde allerede i 1960 overtaget herregården Moesgård og dennes mølle med henblik på at etablere et forhistorisk museum og en forhistorisk naturpark. Glob var ophavsmand til idéen, der også indebar en udflytning af universitetets arkæologi- og etnografistudier. I 1968 blev museet udskilt af Aarhus Museum og flyttet til den tidligere herregård. Naturparken med vilde dyr blev ikke til noget, men det nye museum blev indviet i september 1970 med permanente udstillinger om Danmarks oldtid, en etnografisk sektion samt særudstillinger.
Museet var i 1980’erne førende med landskabsmodeller og flere store udstillinger om Mellemøsten. Samlingerne, fx Illerupfundene, voksede dog i antal, og faciliteterne blev for trange. I parken uden for museet blev en række banebrydende oldtidsbygninger genskabt, bl.a. stavkirken, der er møjsommeligt rekonstrueret efter fund af en trækirke fra vikingetiden i Hørning. I 2014 blev museets nye bygning nord for den gamle herregård indviet under navnet Moesgaard Museum. Bygningen er tegnet af Henning Larsen Architects og tilpasset landskabet af Arkitekt Kristine Jensens Tegnestue. Det græsklædte tag er indpasset i bakkedraget og giver mindelser om en græstørv i kæmpeformat netop løsnet af arkæologens skovl. Arkitekt Kristine Jensens Tegnestue har anlagt en lang lindeallé, vinkelret på det gamle Moesgaards alléer, som adgangsvej til de terrasserede parkeringspladser. Moesgaard Museum eksperimenterer med nye formidlingsformer, og de nye permanente udstillinger er berømmet for deres audiovisuelle og digitale virkemidler.