For bedre at kunne prioritere forvaltningen af naturen har Haderslev Kommune udpeget en række særlig værdifulde naturområder, hvis naturværdier skal sikres og forbedres gennem pleje og andre tiltag. Disse naturområder omfatter bl.a. Årup Hede og hederne i Stensbæk Plantage, Rygbjerg og Vedsted Søer, Abkær Mose, Stengelmose og Starup Hede.
For at give dyr og planter mulighed for at sprede sig mellem naturområderne forbindes de af økologiske forbindelser eller spredningskorridorer. I Haderslev Kommune er næsten alle skovområder samt mange af ådalene udlagt som økologiske forbindelser. Det gælder også en række naturområder op langs Lillebælt, hvilket giver en let fragmenteret forbindelse langs næsten hele den østvendte kyst.
Disse forbindelser skal bl.a. udbygges gennem ny skovrejsning, der desuden skal bidrage til at binde CO2 og skabe ny bynær natur. Områder til ny skovrejsning fordeler sig nogenlunde jævnt over kommunen, men med flere områder nord og syd for Haderslev.
Derudover har Haderslev Kommune sat et mål om, at 75 % af borgerne skal være fysisk aktive i 2023, hvilket bl.a. skal ske gennem et øget friluftsliv. Derfor vil kommunen synliggøre og understøtte friluftslivet, ligesom borgernes adgang til naturen og de grønne områder skal forbedres ved etableringen af gang- og cykelstier.