Alle naturområder i Silkeborg Kommune er blevet målsat ud fra deres aktuelle tilstand og deres potentiale for at udvikle bedre natur. Målsætningen består af fem klasser. Klasse 1 omfatter de mest værdifulde naturområder, hvor der kun må foretages indgreb som naturpleje, der styrker områdernes natur. Blandt klasse 1-områderne er Tingdalsøerne, Vrads Sande, Almind Sø og Slåensø.
Opdyrkning, bebyggelse og infrastruktur øger risikoen for fragmentering af naturområderne. For at sikre dyrenes og planternes spredningsmuligheder er der derfor udpeget et netværk af spredningskorridorer, som forbinder naturområderne med hinanden. Langt de fleste spredningskorridorer ligger i ådalene.
Trods sit i forvejen store skovareal har kommunen udpeget betydelige arealer til mulig skovrejsning. De største arealer, hvor skovrejsning er ønsket, ligger bl.a. omkring Kjellerup, nordøst for Kompedal Plantage og i området mellem Silkeborg og Bølling Sø.
Såvel borgere som turister skal kunne opleve naturen i hele kommunen. Derfor vil kommunen fx etablere flere mødesteder og faciliteter for friluftsliv samt øge tilgængeligheden til friluftsfaciliteter og naturområder ved at udbygge ruter, stier og spor.