Vejle Kommune og tidligere også Vejle Amt har arbejdet med naturforvaltning på mange niveauer. I de senere år er der gradvis kommet større fokus på den biologiske mangfoldighed, og i 2020 kunne kommunen vedtage sin første Biodiversitetsplan. Den nye plan er dels en status over naturens tilstand, dels en handleplan for stabilisering og beskyttelse af de eksisterende naturområder og deres dyre- og planteliv. Derudover indeholder planen et ønske om at udlægge flere områder til natur. Et af de bærende elementer er en såkaldt multifunktionel jordfordeling, hvor landbrugsudnyttelsen optimeres, samtidig med at der frigøres arealer, som enten drives mere ekstensivt eller helt tages ud af den landbrugsmæssige drift.
Et andet indsatsområde i kommunens natur- og landskabsforvaltning er ådalene og de dertil knyttede naturtyper. En af de største trusler mod disse naturtyper er tilgroning, og et af de vigtigste redskaber i naturplejen er derfor græsning. Heri indgår kogræsserlavene, hvor landmænd stiller kreaturer til rådighed for en gruppe borgere, som vil føre det daglige tilsyn og samtidig aftage kødet, når dyrene efterfølgende skal slagtes. Derudover støtter og faciliterer kommunen kogræsserlavene ved både at identificere arealerne med de største græsningsbehov og ved at bidrage med fx hegning og vandingsanlæg.
De mange naturområder spiller også en vigtig rolle for friluftslivet, som selv er af stor betydning for bosætningen og tiltrækningen af turister til ikke bare Vejle Kommune, men hele Trekantområdet. Friluftslivet og friluftsturismen har bl.a. fokus på vandring, cykling, fiskeri og sejlads, og i forvaltningen arbejdes der bl.a. på at udbygge og forbedre faciliteterne for søsport og sejlads på Vejle Fjord, at sikre adgangen til naturområderne samt at anlægge støttepunkter og på anden måde forbedre oplevelsesmulighederne.