Kommunen har udpeget en række værdifulde naturområder, som overvejende falder sammen med Natura 2000-områderne, de fredede arealer samt skove med fredskovspligt. Af hensyn til såvel dyre- og plantelivet som borgernes rekreative muligheder må tilstanden i naturområderne ikke forringes. For at sikre spredningsmulighederne for dyr og planter mellem de ofte adskilte arealer er naturområderne forbundet af økologiske forbindelser, som især ligger i ådalene.
I forbindelse med regeringens mål om at øge skovarealet til 20‑25 % af landets areal inden for en trægeneration har Viborg Kommune udpeget i alt ca. 13.000 ha til mulig ny skovrejsning. De nye skove skal både styrke naturen, øge borgernes muligheder for friluftsliv og beskytte drikkevandsressourcerne. Arealerne fordeler sig nogenlunde jævnt ud over kommunen, men ligger bl.a. nord for Viborg samt i forbindelse med eksisterende skovområder.
Det er et mål for Viborg Kommune, at borgerne har mulighed for at dyrke friluftsliv inden for en rimelig afstand af deres bopæl. Det skal bl.a. indtænkes ved udlægning af nye boligområder. Samtidig vil kommunen forbedre adgangen til naturen gennem etablering og vedligeholdelse af stier, raste- og parkeringspladser.