I Københavns Kommune er 53 % af indbyggerne medlemmer af folkekirken mod 74,7 % på landsplan (1. jan. 2019). Antallet af medlemmer er dog, ligesom befolkningstallet i kommunen, stigende, mens medlemsprocenten, der er den laveste i landet, fortsat er faldende. Efter sammenlægninger i 2012 rummer kommunen seks provstier. I kraft af omfattende sognesammenlægninger i perioden 2008‑19 er 69 sogne blevet reduceret til 57. Af disse er sammenlægningen af otte sogne på Vesterbro i årene 2012‑13 den mest omfattende.
Nogle kirker har langt tilbage i tiden haft en særlig profil, som afspejler Københavns historiske status som universitetsby og hovedstad. Den teologiske uddannelse lå indtil 1942 udelukkende ved universitetet i København, og de teologistuderende var fra 1658 tilknyttet Trinitatis Kirke, efter at det midlertidige kapel på Regensen blev nedlagt. Kirken var indtil 1868 under universitetets patronat. I 1965 fuldtidsansatte folkekirken landets første studenterpræst, der blev knyttet til netop Trinitatis Kirke. Der er i 2020 ansat tre studenterpræster, som hører til hhv. Sankt Johannes Kirke på Sankt Hans Torv, Nørrebro, Hans Tausens Kirke på Islands Brygge og Kirken i Ørestad. Danmarks første gadepræst blev ansat ved Trinitatis Kirke i 1993. Præsten henvendte sig til unge i nattelivet. For at målrette kirken til de yngre kirkegængere har Brorsons Kirke og Gethsemane Kirke siden hhv. 1998 og 2012 ansat en særlig ungdomspræst.
Syv præster er tilknyttet kommunens hospitaler, heraf fire på Rigshospitalet og tre på Bispebjerg Hospital. Der er tre præster ved Vestre Fængsel, hvoraf en også betjener Blegdamsvejens Arrest. I år 2000 blev den første fuldtidsansatte natkirkepræst ansat ved Vor Frue Kirke, og 20 år senere har otte af kommunens kirker en natkirkepræst ansat.
Siden årtusindskiftet er en række nye gudstjenesteformer og aktiviteter blevet udviklet for at imødekomme særlige grupper som børnefamilier. Der er fx børnegudstjenester, gudstjenester med fællesspisning, yoga- og mindfulnessgudstjenester, graviditets- og fædregrupper, fællesspisning og fællessang samt babysalmesang. Byens Valgmenighed, som blev stiftet i 2008 som en udløber af Aarhus Valgmenighed, benytter baptisternes Kristuskirken på Nørrebro.
Byens Valgmenighed er knyttet til Dansk Oase (grundlagt 1989), som er en fællesorganisation for karismatiske menigheder inden for folkekirken. En anden Dansk Oase-valgmenighed er Betlehemsfællesskabet fra år 2000 i folkekirken Betlehemskirken på Nørrebro.
Mere om religion og trossamfund i København
- Religion og trossamfund i Bispebjerg
- Religion og trossamfund i Brønshøj-Husum
- Religion og trossamfund i Vanløse
- Religion og trossamfund i Valby
- Religion og trossamfund på Østerbro
- Religion og trossamfund på Nørrebro
- Religion og trossamfund på Vesterbro-Kongens Enghave
- Religion og trossamfund i Indre By
- Religion og trossamfund i Amager Øst
- Religion og trossamfund i Amager Vest