I Sønderborg Kommune dækker skovene tilsammen 5.051 ha, hvilket svarer til ca. 10 % af kommunens areal. Skovene ligger overvejende på frodig morænebund i et bakket landskab med skrænter og smeltevandsdale.
Kommunens største skove udgøres af de gamle hertugelige jagtskove Gråstenskovene, Sønderskov og Nørreskov. De har i generationer været drevet forstligt med især løvskovsdrift, og der er derfor ikke megen oprindelig, naturlig skov tilbage. I dag ejes de tre skove af Naturstyrelsen, som driver dem ud fra naturnære principper. Inden for de senere år er større arealer desuden udlagt til urørt skov. Naturstyrelsen ejer også enkelte mindre skove, der ligger spredt i kommunen, heriblandt Dyrehaven ved Rumohrsgård, som især gør sig bemærket ved sit varierede planteliv og mange kulturminder.
Ud over statsskovene rummer kommunen en række bønderskove med flere forskellige ejere. Mange af dem har været drevet som stævningsskove, hvor bevoksningerne er skåret ned for efterfølgende at skyde på ny fra stubbene. De fleste steder er stævningsdriften for længst ophørt, og skovene vokset op i flere etager. Rester af de gamle stævningsskove kan bl.a. opleves ved landsbyerne Brandsbøl og Stolbro.
