Flere steder har naturgenopretningsprojekter ført Suså tilbage til sit oprindelige forløb, fx ved Rødebro, hvor åen er blevet genslynget, og gennem Næstved er hovedparten af åens løb blevet frilagt. Sluserne ved Holløse Mølle og Rådmandshaven i Næstved dæmmer fortsat vandet op, men måske vil spærringerne blive fjernet i fremtiden.
Regulering og forurening har reduceret plante- og dyrelivet i Suså. I 1896 var der 17 arter af vandaks i åen. I dag er der kun seks arter tilbage. Den hvidfinnede ferskvandsulk uddøde, men et stort naturgenopretningsprojekt skal hjælpe den tilbage.
Ligesom i andre store vandløb med søer er der mange fiskearter. I år 2000 blev der registreret 21 fiskearter: aborre, brasen, bæklampret, elritse, flire, gedde, grundling, helt, hork, karusse, knude, løje, nipigget hundestejle, pigsmerling, rimte, rudskalle, skalle, suder, trepigget hundestejle, ørred og ål. Der findes seks arter af store ferskvandsmuslinger: tykskallet, ægte og tilspidset malermusling, stor og alm. dammusling samt den invasive art vandremusling. Der er mange fugle langs åen, som hver vinter besøges af vandstær, og bjergvipstjert og isfugl yngler.
