Ca. 14 km øst for Børglumkloster ligger Vrejlevkloster. Den nære indbyrdes beliggenhed er ikke tilfældig, idet de to klostres historie er tæt forbundet. Begge tilhørte præmonstratenserordenen, hvis mandlige kannikker beboede Børglum, mens Vrejlev var ordenens eneste nonnekloster i Norden. Klostrenes ældste historie ligger hen i det uvisse; én teori er, at Vrejlev kan have været en forgænger for Børglum, hvortil kannikkerne i så fald flyttede i begyndelsen af 1200-tallet. Nonnekonventet menes oprettet i samme periode og kendes med sikkerhed fra 1253-54. Organisatorisk var Vrejlev underlagt Børglum som datterkloster, ligesom kannikker derfra fungerede som nonnernes præster og godsbestyrere (priorer). At der skulle have løbet en underjordisk tunnel mellem de to klostre, er dog en skrøne.
Da klosteret ved Reformationen blev underlagt kronen, fik de af nonnerne, der ønskede det, lov til at blive boende under kongelige godsforvaltere, hvilket nogle endnu gjorde i 1560. Stedet overgik i 1575 til privat eje og fortsatte som herregård, stadig under navnet Vrejlevkloster. Klosterkirken er i dag sognekirke i Vrejlev Sogn.