Kvistgård opstod omkring Kvistgård Station, der i 1864 blev anlagt på Nordbanen. I 1870’erne blev Kvistgaard Teglværk opført, og i 1897 flyttede trævarevirksomheden Havreholm Fabrikker A/S til byen.
I 1930’erne var Kvistgård blevet en selvstændig by med flere købmænd, en slagter, en bager, en manufakturhandler og pengeinstitutter. Et område nær byen blev i begyndelsen af 1960’erne udstykket til industrivirksomheder, men bylivet oplevede i samme årti en krise, da byens skole, Nyrup Skole, lukkede i 1963.
Forsøg på at få en skole igen og at udbygge Kvistgård blev ikke støttet af Helsingør Byråd. Først i 1980’erne blev arealet langs Oldenvej og Porthusvej og nord for Munkegårde Hegn bebygget. I 1970 havde byen 638 indbyggere, og fra 1981 til 2007 svingede befolkningstallet. I 1999 lukkede byens posthus. I 2007 boede der 852 indbyggere i Kvistgård.
