Sophienbergs oprindelige symmetriske have med seks kvarterer mod vest og en terrasseret, svejfet terrænform mod Øresund var formentlig tegnet af Niels Eigtved i 1740’erne og omgivet af alléer og en havemur. Enkelte oprindelige lindetræer findes stadig. Ud i landskabet mod vest fortsætter en lang – nu genplantet – allé af hestekastanjer, der udgør anlæggets centralakse, svarende til det oprindelige anlæg til landstedet Kokkedal.
Ved restaurering og tilbygning i slutningen af 1980’erne er den formelle have gendigtet af arkitekt Cornelia Zibrandtsen. Inden for den gamle havemur er skabt et haverum med forsænket plæne, tværgående vandrende og bassin. Trægrupper i begge ender og afgrænsningen på de to langsider udgøres af formklippede bøgehække, der er rester af det oprindelige haveanlæg. Mod øst markerer en rombeformet hæk den stejle skråning mod sundet.
