Herlev Kommune er fattig på søer, og de, der findes, er alle småsøer og vandhuller. I alt findes der 79 søer på mindst 100 m2. De dækker tilsammen 17 ha, hvilket svarer til 1,4 % af kommunens areal. Søerne er ofte forbundet med hinanden eller med vandløbene via rørledninger og grøfter. De fleste ligger i Hjortespringkilen i nord, om end også byparkerne rummer enkelte søer.
Antallet af vandløb er også yderst beskedent. De to største er Tibberup Å og Kagså, som begge udspringer ved Smørmose. Mens Tibberup Å kort efter udspringet løber til kommunegrænsen i nord, følger Kagså den østlige kommunegrænse sydpå og forlader kommunen ved Kagsmose mellem Frederikssundsvej og Motorring 3 i sydøst.
