Der findes flere ikke-protestantiske kristne kirker i Danmark, hvoraf den romerskkatolske kirke er den største.
Allerede før indførelsen af religionsfrihed i 1849 var det muligt at være udøvende katolik i Danmark. I 1765 blev der bygget et beskedent kapel i Bredgade i København, og 1841‑42 opførtes Sankt Ansgars Kirke på samme grund. Kirken hørte formelt under den østrigske stat. Først efter Grundloven i 1849 blev kirken dansk med ret til at ringe til messe. I 1868 oprettedes et katolsk præfektur i Danmark, og i 1892 et apostolsk vikariat. I denne periode opførtes en lang række katolske kirker i landet, både sognekirker og kirker for udenlandske ordenssamfund. I 1953 etableredes et katolsk bispedømme, Bispedømmet København. Ud over domkirken i Bredgade findes i København Jesu Hjerte Kirke i Stenosgade, der 1892‑95 opførtes for jesuiterordenen, men som i 1942 blev omdannet til sognekirke. Immaculatakirken på Strandvejen er opført for Sankt Joseph Søstrene 1904‑05. Desuden findes Sankt Annæ Kirke på Amager, der er opført 1936‑38 af Sven Risom i romanske former. Sakramentskirken (1899) på Nørrebrogade er indføjet i husrækken og er tegnet af den hollandske arkitekt Jan Stuyt. Sankt Augustinus Kirke eller Klosterkirken på Jagtvej opførtes 1912‑16 for Den Evige Tilbedelses Orden, hvis bygninger i dag rummer Niels Steensens Gymnasium. Den danske arkitekt Vilhelm Wohlert tegnede San Antoni Kirke i Brønshøj.
Der lever lidt over 47.000 katolikker i Danmark. Langt de fleste provinsbyer har katolske menigheder med egen kirke, men derudover findes en række kapeller og gudstjenestesteder, hvor der lejlighedsvis holdes messe.
Den katolske kirke er en verdenskirke, som i 1960’erne valgte at forlade latin som messesprog til fordel for de lokale sprog. Dette var undertiden en torn i øjet på de protestanter, der siden 1800-tallet var konverteret til den traditionelt konservative, latinsksprogede kirke. Det var ikke blot dansk, der nu blev messesprog, men i takt med indvandringsbølger ændredes menighedernes sammensætning drastisk. Det har medført, at der afholdes messe på en lang række sprog i den katolske kirke i Danmark: vietnamesisk, pilipino, polsk, tamilsk, kroatisk, engelsk, tysk og flere andre. Kirkerummene har flere steder også fået præg af de nye medlemmers medbragte kulturer.
