Landbruget er af stor betydning i Morsø Kommune, både landskabeligt, miljømæssigt, kulturelt og økonomisk, og hensynet til landbruget spiller derfor en væsentlig rolle i forvaltningen af naturen og landskabet. Kommunen betragter således dyrkningsjorden som en begrænset ressource, der skal beskyttes, og arbejder for at sikre landbruget de bedst mulige produktionsbetingelser.
Morsø Kommune har også en række værdifulde landskaber og naturområder som molerskrænterne og den lange, varierede kystlinje. I Kommuneplan 2013-25 udtrykker kommunen ønske om også at sikre disse eksisterende naturområder, at skabe plads til naturen omkring byerne og i landbrugslandet samt at udbygge nettet af spredningskorridorer for dyr og planter.