Siger man Skanderborg og musik, siger man også Smukfest. Mere end 50.000 musikelskere samles hvert år på festivalen, hvor de fleste bor i telte på bl.a. Kærligheden og i Skovlunden, begge steder ejet af de mere end 17.000 medlemmer af Skanderborg Festivalklub, som også ejer Smukfest. Byens spillested Walthers Musikcafé, opkaldt efter festivalens maskot, FestiWalther, har ugentlige arrangementer med et bredt udbud af rytmiske koncerter hen over året og støttes økonomisk af Skanderborg Festivalklub.
I Kulturhuset Skanderborg er et stort udbud af koncerter i alle genrer. Skanderborg Kulturskole tilbyder en bred vifte af musiktilbud til kommunens borgere. Der er et rigt amatørliv i kommunen, og kirkerne har jævnligt klassiske koncerter. Sangskriveren Peter Sommer er vokset op i Skanderborg og har bl.a. leveret en række hits og fået en lang række priser for sin produktion, som også omfatter duosamarbejdet De Eneste To med Simon Kvamm, der er vokset op i nabobyen Silkeborg.