De kulturhistoriske museer i Morsø Kommune fokuserer på købstadshistorie, landbrugshistorie, kirke- og klosterhistorie samt industrihistorie. Museum Mors er øens statsanerkendte museum med kulturhistorisk og geologisk ansvarsområde. I Nykøbing M’s nordlige ende ligger Dansk Støberimuseum. På den nordlige del af øen ligger afdelingen Landbrugsmuseet Skarregaard, der præsenterer landbrugshistorien på Mors.
Ud over det statsanerkendte museums afdelinger finder man Morsø Traktormuseum i Ovtrup, Erslev Kalkovn og Morsø Gamle Smedje i Ørding, der alle er drevet af frivillige.