Senest i 1538, men muligvis allerede i 1400-tallet udskiltes Sønderho som et selvstændigt sogn, mens det nordlige sogn bibeholdt navnet Fanø. Herfra stammer betegnelserne »fannik« og »sønderhoning«, som betegnelse for en indbygger fra hhv. Nordby og Sønderho. Fannik bruges dog også som betegnelse for en person fra Fanø.
Selv om søfartserhvervet for længst er forsvundet fra øen, er traditioner fra søfartstiden fortsat levende. Siden begyndelsen af 1900-tallet har fannikker og sønderhoninger hver sommer inviteret turister og sommerhusejere med til byfester og optog, hvor Fanødragter vises frem, og der bydes op til spillemandsmusik og dans. Fanø Museumsforening fra 1918 og Fonden Gamle Sønderho fra 1928 har siden deres oprettelse arbejdet for at bevare lokale traditioner fra hhv. Nordby og Sønderho.
Fonden Gamle Sønderho har siden sin stiftelse afholdt Sønderhodag. I Nordby har Foreningen Fannikerdagen afholdt byfest hver sommer siden 1953. Fannikerdagene løber over tre dage i juli med optog med fanødragter, musik og dans, og overskuddet går til bevaring af øens kulturarv.
Øens mange traditioner har også værdi for tilflyttere, som via skikkene får adgang til fællesskabet på øen. Om vinteren, når øens sommerhusgæster og turister er væk, og de mørke aftener sætter ind, mødes øens dragtentusiaster for at sy på dragterne eller gå til folkedans i forsamlingshuset Strien i Nordby.
Om sommeren afholdes en række musikfestivaler, som trækker tråde til øens spillemandstraditioner. Men der finder også andre festivaler sted, fx Fanø International Kite Fliers Meeting. Fodboldstævnet Fanø Sommer Cup fra 1980 er Danmarks største femmandsstævne.