Langt størstedelen af det åbne land i Roskilde Kommune er opdyrket, og selv om landbrugsområderne også rummer mindre naturlokaliteter i form af især småmoser og vandhuller, er andelen af naturområder forholdsvis beskeden. I alt dækker enge, moser, overdrev og strandenge omkring 6 % af kommunens areal. Den største andel udgøres af enge og moser, som overvejende ligger i tilknytning til ådalene, især i Ramsødalen samt ved Hove Å og Gundsømagle Sø. Strandenge og overdrev når deres største udstrækning langs kysten, om end overdrevene også kan findes inde i landet.
Især syd for Roskilde er der store grusforekomster i undergrunden, og egnen er derfor præget af tidligere og igangværende råstofindvinding. Darup Grusgrav er eksempelvis blevet genetableret som natur- og rekreativt område med badestrand ved Himmelsøen i bunden af grusgraven. Mod sydøst ligger også Hedeland, hvor der er anlagt en naturpark i de reetablerede grusgrave.
I 2015 genudsatte kommunen løvfrøer i et område mellem Roskilde og Svogerslev. Haletudser og nyforvandlede frøer blev udsat i særlig egnede lavvandede og soleksponerede vandhuller på græssede enge. Udsætningen har været en succes, og løvfrøerne spreder sig nu til flere vandhuller på egnen.
