Østsjællands Museum har det kulturhistoriske og geologiske ansvar for Faxe Kommune, mens det arkæologiske ansvar ligger hos Museum Sydøstdanmark. I 1997 blev Østsjællands Museum statsanerkendt. Museet er opstået gennem flere sammenlægninger af Stevns Museum, Fakse Museum, Fakse Geologiske Museum og senest i 2010 Haslev Museum. Museets centrale udstillingssteder i kommunen er Geomuseum Faxe og Kulturmuseum Øst i Faxe.
I kommunen ligger også SEAS-NVE’s El-museum i Haslev fra 1978, mens en miniversion af Faxe Ladeplads fra perioden 1900-20 kan opleves i Faxe Ladeplads Miniby og Park, grundlagt i 1999. Blåbæk Møller og Gisselfeld er åbne for rundvisninger.
Faxe Kommunes Arkiver blev oprettet i 2008 som sammenlægning af Haslev Lokalhistoriske Arkiv fra 1973 og Fakse Rønnede Lokalhistoriske Arkiv fra 1965. I 2011 blev Faxe Kommunes Arkiver også kommunearkiv. Faxe Kommunes Arkiver arrangerer også skiftende udstillinger.
