Furesø Kommune rummer store naturværdier, som skal sikres og forbedres ved at beskytte naturområderne og styrke den biologiske mangfoldighed. Samtidig skal borgerne have gode muligheder for naturoplevelser og motion i det fri. I forbindelse med udarbejdelsen af Grønt Danmarkskort er der udpeget en række områder med særlige naturbeskyttelsesinteresser. Disse områder omfatter hovedsagelig de store skovområder i kommunen samt Furesø, Farum Sø, Søndersø og Præstesø. Områderne bindes sammen af såkaldte økologiske forbindelser. Dette samlede »naturnetværk« skal beskyttes mod byudvikling, vejanlæg og lignende.
En meget stor del af kommunen er allerede dækket af skov, og der er derfor ikke noget ønske om at udvide skovarealet. Til gengæld har kommunen udpeget flere områder, der kan genoprettes som tør eller våd natur, herunder området mellem Bregnerød og Ravnsholt samt områder ved Bringe Mose og Bundsmose. Derudover vil kommunen restaurere strækninger af Tibberup Å, Jonstrup Å og Bundså.
Af hensyn til friluftslivet skal adgangen til søerne, skovene og det åbne land opretholdes og forbedres. Det skal bl.a. ske ved at udbygge det rekreative stinet, så det forbinder byerne med landområderne og giver mulighed for rundture i det åbne land.