Jammerbugt Kommune er omgivet af hav og fjord, og både naturen og landskaberne er en meget stor del af kommunens identitet. Landskabet står derfor også højt på den politiske dagsorden, og der har siden Strukturreformen i 2007 været et stort fokus på både at beskytte og benytte de store natur- og landskabsværdier. Blandt de mest fremtrædende projekter er Lien, Fosdalen og Sandmosen, hvor der er lavet nye stiforløb, hegningsprojekter og naturplejetiltag. Derudover er kommunen ved at gennemgå sine mange fredninger for bl.a. at nytænke, hvordan de bedst kan formidles. I de senere år er der eksempelvis gjort en indsats for at fortælle historien om Store Vildmose.
Kysten og de kystnære områder er af stor geologisk og landskabelig interesse, men har været hårdt ramt af sandflugt. For at bekæmpe sandflugten blev der etableret læhegn og klitplantager langs det meste af kysten. I dag er mange af kystens lysåbne naturtyper dog truet af tilgroning af især bjergfyr fra klitplantagerne. Kommunen arbejder derfor på at bevare den lysåbne natur ved naturpleje i form af bl.a. afgræsning.
Ved Limfjorden har man ved inddæmning, dræning og pumpning omdannet dele af fjordbunden til landbrugsjord. I dag trues disse inddæmmede områder især af storme, og behovet for kystbeskyttelse på Limfjordskysten er derfor øget.