Museum Skanderborg har ansvaret for arkæologi og nyere tids kulturhistorie i Skanderborg Kommune. Museet omfatter i 2019 ud over hovedadressen tre afdelinger: Øm Kloster Museum, Museet på Gl. Rye Mølle og Skanderborg Bunkerne.
Indtil 2018 lå i Ry et Ferskvandsmuseum, som nu er lukket. Samlingerne, som bl.a. omfatter en række både, er på magasin, mens bygningerne er nedrevet.
