Landskabet i den nuværende Fredensborg Kommune veksler mellem skovdækkede og mere åbne landskaber, slotsparken samt de bymæssige bebyggelser i Fredensborg og langs kysten. I Danstrup Hegn mod nord, langs Esrum Sø og længere mod syd findes større, gamle skovpartier. Det største skovareal findes i Grønholt Sogn, hvor 27 % af arealet er skovdækket. I gennemsnit er 20 % af kommunen skovdækket, hvilket er 25 % over landsgennemsnittet. Landbrug og gartneri udgør 42 % af arealet, og de åbne landbrugslandskaber findes især i de centrale dele af kommunen. Med 0,3 % af arealet mod et landsgennemsnit på 2,7 % er andelen af tørre, beskyttede naturtyper lav. Det skyldes muligvis en høj andel af by og skov. I forbindelse med søerne, kysterne og vandløbene findes til gengæld en ganske stor andel af våde naturtyper, som tilsammen dækker 11 % af kommunens areal i forhold til en andel på 7 % for landet som helhed.
Landbrugsarealet har generelt været faldende over de seneste par generationer. Således er mere end en tredjedel af landbrugsarealet forsvundet siden 2. Verdenskrig. Faldet i husdyrproduktionen har været endnu mere drastisk. Antallet af kvæg har været faldende siden 1950’erne, mens kommunen kunne opretholde en betydelig svineproduktion helt frem til begyndelsen af 1980’erne. I dag er både kvæg- og svineproduktionen ganske ubetydelig. Derimod har antallet af heste været stærkt stigende og udgør i dag næsten to tredjedele af dyreenhederne. Den sidste tredjedel udgøres overvejende af kvæg. Frem til 1980’erne fulgte strukturudviklingen i landbruget det øvrige Danmark. I de seneste år har den gennemsnitlige bedriftsstørrelse været faldende (se Figur 1), og i dag består landbruget i meget høj grad af hobby- og deltidsbrug.
Græsningsarealer til heste og kvæg udgør en forholdsvis stor andel af landbrugsarealet. I 2010 var 27 % af landbrugsarealet således græs i omdrift, mens 21 % var vedvarende græs. Til sammenligning udgjorde de samme andele på landsplan hhv. 20 og 9 %. Selv om kornarealet samlet set er faldet med 65 % fra 1980 til 2010, udgør korn stadig ca. 33 % af arealet og er dermed den mest dyrkede afgrøde i kommunen.
De lerblandede sandjorder er naturligt veldrænede og afvander kommunen til hhv. Øresund i øst og via Esrum Sø og Å til Kattegat i nord. Kombineret med et planteavlsdomineret landbrug og en lav husdyrtæthed betyder det, at belastningen af vandmiljøet er forholdsvis lav.