Tilsammen dækker landbrug og gartneri i dag ca. 57 % kommunens samlede areal, hvilket er lidt under landsgennemsnittet på 61 %. Landbrugsarealet er dog ikke jævnt fordelt, og i Ferslev, Skuldelev, Kyndby og Krogstrup Sogne i Hornsherred samt i Sigerslevvester og Snostrup Sogne hhv. nord og syd for Frederikssund dækker landbruget over 70 % af arealet. Derimod ligger andelen af landbrug betydeligt under gennemsnittet omkring bl.a. Frederikssund, Slangerup, Jægerspris, Skibby og Vellerup samt ved Nordskoven og sommerhusområderne på nordspidsen af Hornsherred. Andelen med skov ligger på ca. 15 %, hvilket næsten svarer til landsgennemsnittet på 16 %. Også andelen af både våde og tørre naturområder ligger med andele på hhv. 6,5 og 1,9 % kun en smule under landsgennemsnittet.
Jordbunden i det bakkede morænelandskab er meget varieret. På landbrugsfladen består den hovedsagelig af veldrænede, sand- og lerblandede jorder, men omfatter også magre, fin- og grovsandede jorder; især på nordspidsen af Hornsherred, på Selsøs strandenge og ved Vellerup. I de lavereliggende engpartier findes desuden en del humusjorder.
Det samlede landbrugsareal i kommunen var højt i slutningen af 1800-tallet og frem til lige efter 2. Verdenskrig, men er siden faldet betydeligt. Målt i dyreenheder faldt det samlede husdyrhold med hele 57 % fra 1980 til 2010. Således gik antallet af kvæg og svin tilbage med hhv. 60 % og 58 %, om end hesteholdet steg med næsten 29 %.
De dyrkede afgrøder minder meget om sammensætningen i landet som helhed. Eksempelvis dækker salgsafgrøder i form af korn og industrifrø 64 % af arealet mod 61 % på landsplan, 26 % af arealet er udlagt til græs og grøntfoder mod 29 % på landsplan, og de 3 % af arealet, hvor der dyrkes rodfrugter, svarer til landsgennemsnittet. Af rodfrugter udgør spisekartofler næsten hele arealet. I forhold til det øvrige Sjælland betyder de sandede jorder, at en forholdsvis stor andel af arealet kan vandes. Det udnyttes både i kartoffeldyrkningen og til frilandsgartneri.
Frem til ca. 1990 lå den gennemsnitlige bedriftsstørrelse en smule over landsgennemsnittet. Selv om udviklingen er fortsat mod stadig større bedrifter, er den gået langsommere i Frederikssund Kommune end i landet som helhed. I 2010 lå den gennemsnitlige bedriftsstørrelse i Frederikssund Kommune således på kun 46 ha mod et landsgennemsnit på 64 ha.
Kombinationen af kystnærhed, de sandede jorders ringe evne til at tilbageholde næringsstoffer og et stort dyrket areal medfører en stor risiko for udvaskning. De inderste dele af Roskilde Fjord er særlig sårbare over for forurening med spildevand og næringsstoffer fra landbruget. Den større vandudskiftning i Isefjord betyder til gengæld, at vandmiljøet på vestsiden af Hornsherred er mindre sårbart.